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研究与数据分析
(401)
D
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DeepVariant
利用深度神经网络识别下一代 DNA 测序数据中遗传变异的分析流程。
人工智能研究工具
G
open source
GENERator
具有长上下文窗口的生成式基因组基础模型。
人工智能研究工具
G
open source
GENERanno
用于宏基因组注释的基因组基础模型。
人工智能研究工具
G
open source
GPN
包括 GPN、GPN-MSA、PhyloGPN 和 GPN-Star 的基因组预训练模型系列。
人工智能研究工具
A
open source
AlphaGenome API
AlphaGenome 基因组预测 API 的客户端库。该托管 API 需要密钥,依条款面向非商业研究提供;预测不得用于临床决策。
人工智能研究工具
B
open source
BioReason
用于多模态生物学推理的 DNA 与语言模型架构。
人工智能研究工具
G
open source
gReLU
用于训练、解释及应用 DNA 序列深度学习模型的 Python 库。
人工智能研究工具
D
open source
DNABERT-2
面向多物种基因组分析的基础模型与基准。
人工智能研究工具
O
open source
OmicVerse
用于群体、单细胞和空间 RNA 测序数据多组学分析的 Python 库。
人工智能研究工具
M
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mLLMCelltype
利用多个语言模型的共识,对单细胞 RNA 测序数据进行细胞类型注释的工具。
人工智能研究工具
C
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CellTypist
用于半自动细胞类型分类的工具。
人工智能研究工具
C
open source
CellWhisperer
连接转录组数据与自然语言、支持与单细胞 RNA 测序数据集交互的模型。
人工智能研究工具
U
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UCE
面向单细胞基因表达数据的零样本基础模型。
人工智能研究工具
S
unknown
scTranslator
根据转录组数据推断单细胞蛋白质丰度的预训练生成模型。
人工智能研究工具
S
open source
scDFM
用于单细胞扰动预测的分布流匹配模型。
人工智能研究工具
G
open source
GEARS
预测新多基因扰动结果的几何深度学习模型。
人工智能研究工具
H
open source
Helical
用于基因组学与转录组学预训练生物基础模型的框架。
人工智能研究工具
C
open source
CellRank
从单细胞数据的多个视角分析细胞动态的框架。
人工智能研究工具
S
open source
scvi-tools
对单细胞与空间组学数据进行深度概率分析的框架。
人工智能研究工具
S
unknown
State (Arc Institute)
预测不同情境下细胞扰动响应的机器学习模型。
人工智能研究工具
S
unknown
Stack (Arc Institute)
支持在推理时进行上下文学习的单细胞基础模型。
人工智能研究工具
T
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Tahoe-x1
面向大规模数据集的单细胞基础模型。
人工智能研究工具
S
open source
scPRINT
从单细胞 RNA 测序数据推断基因网络的 Transformer 模型。
人工智能研究工具
N
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Nicheformer
面向单细胞与空间组学的基础模型。
人工智能研究工具
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