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研究与数据分析(401)

Copen source
CodonFM
以密码子为粒度处理蛋白质编码序列的语言模型系列。
人工智能研究工具
Copen source
Caduceus
用于长 DNA 序列双向等变建模的模型。
人工智能研究工具
Hopen source
HyenaDNA
基于 Hyena 架构的长程基因组基础模型。
人工智能研究工具
Nunknown
Nucleotide Transformer
面向基因组学与转录组学的基础模型。
人工智能研究工具
Copen source
Carbon (Hugging Face)
Hugging Face 的基因组基础模型。
人工智能研究工具
Gunknown
GB.ModelGenerator
用于适配预训练模型并生成面向下游科研任务的微调模型的软件栈。
人工智能研究工具
Gopen source
gRNAde
基于三维结构与功能进行 RNA 逆向设计的生成式 AI 框架。
人工智能研究工具
Ropen source
RNAPro
用于 RNA 三维折叠结构预测的模型。
人工智能研究工具
Ropen source
RiNALMo
面向 RNA 序列的语言模型。
人工智能研究工具
Ropen source
RNA-FM
面向 RNA 的基础模型。
人工智能研究工具
Nopen source
NuFold
采用灵活核碱基中心表征的端到端 RNA 三级结构预测模型。
人工智能研究工具
Ropen source
RhoFold+
利用语言模型进行 RNA 三维结构预测的深度学习模型。
人工智能研究工具
Mopen source
mosaic
面向复合目标蛋白质设计的框架。
人工智能研究工具
Iunknown
ImmunoStruct
用于科研中免疫原性预测的多模态深度学习框架。
人工智能研究工具
Fopen source
Foldseek
用于搜索和比较蛋白质结构的工具。
人工智能研究工具
Dopen source
DPLM
扩散式蛋白质语言模型系列。
人工智能研究工具
Eunknown
EVOLVEpro
利用小样本主动学习进行蛋白质活性计算定向进化的模型。
人工智能研究工具
Aunknown
AiCE
利用蛋白质逆折叠模型预测突变适应度的科研模型。
人工智能研究工具
Iopen source
InterPLM
利用稀疏自编码器发现蛋白质语言模型中可解释特征的工具。
人工智能研究工具
Sopen source
SaProt
采用氨基酸与结构字母表的蛋白质语言模型。
人工智能研究工具
Popen source
ProstT5
面向蛋白质序列与结构两种表征的双语语言模型。
人工智能研究工具
Popen source
ProGen3
提供评分与生成接口的蛋白质模型，模型权重仅许可非商业使用。
人工智能研究工具
Popen source
ProtTrans
面向蛋白质的预训练语言模型。
人工智能研究工具
Eunknown
ESM (Biohub)
提供 ESMC 表征和 ESMFold2 结构预测的蛋白质模型工具包。
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