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研究与数据分析
(401)
O
open source
OpenDDE
用于结构预测、设计与优化的生物分子模型预览版,目前尚不面向生产流程。
人工智能研究工具
O
unknown
ODesign
用于生物分子相互作用设计的世界模型。
人工智能研究工具
P
open source
PXDesign
将扩散生成器与筛选用置信度模型结合的蛋白质结合体设计模型套件。
人工智能研究工具
P
unknown
Proteina-Complexa
结合流模型与推理时优化的蛋白质结合体设计生成模型。
人工智能研究工具
N
unknown
NeuralPLexer
用于预测特定构象状态下蛋白质—配体复合物结构的多尺度深度生成模型。
人工智能研究工具
S
open source
SimpleFold
支持 PyTorch 和 MLX 推理后端的蛋白质结构预测软件。
人工智能研究工具
I
open source
IntelliFold
面向通用和专门生物分子结构预测任务的可控基础模型。
人工智能研究工具
R
unknown
RoseTTAFold-All-Atom
用于预测包含蛋白质、核酸、小分子、共价修饰和金属的生物分子组装体的神经网络。
人工智能研究工具
O
open source
OpenFold
用于蛋白质结构预测、可训练的 AlphaFold 2 PyTorch 重新实现。
人工智能研究工具
R
unknown
RareFold
用于含非标准氨基酸蛋白质的结构预测与设计的工具。
人工智能研究工具
A
open source
AlphaPulldown
用于蛋白质折叠和蛋白质复合物预测的工作流,支持筛查不同蛋白质集合之间的相互作用。
人工智能研究工具
A
open source
AlphaFold 3
用于生物分子结构预测的 AlphaFold 3 推理流程代码实现。模型参数另有使用条款。
人工智能研究工具
M
open source
ModelAngelo
根据冷冻电子显微镜密度图自动构建原子模型的程序。
人工智能研究工具
C
open source
CryoDRGN
用于冷冻电子显微镜结构重建的神经网络软件。
人工智能研究工具
S
open source
sbi
用于基于模拟的推断的 Python 包,为研究人员和实践者提供接口。
人工智能研究工具
E
open source
exponax
基于 JAX 的 n 维偏微分方程可微求解器。
人工智能研究工具
P
open source
PhiFlow
面向机器学习的可微偏微分方程求解框架。
人工智能研究工具
T
open source
TensorMesh
面向 PyTorch、无需即时编译的可微有限元库。
人工智能研究工具
G
unknown
GAOT
面向任意形状区域中偏微分方程的神经替代模型,采用几何感知算子 Transformer。
人工智能研究工具
P
unknown
Poseidon
面向偏微分方程的基础模型研究实现。
人工智能研究工具
P
open source
pykan
Kolmogorov-Arnold 网络的实现。
人工智能研究工具
P
open source
PSRN
利用 GPU 并行枚举和表达式子树复用来发现符号表达式的系统。
人工智能研究工具
N
unknown
NeuroMANCER
用于参数化约束优化、融合物理知识的系统辨识和模型预测控制的 PyTorch 框架。
人工智能研究工具
C
unknown
Catalyst.jl
SciML 科学机器学习生态中用于化学反应网络和系统生物学的接口。
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